Елена Воробьева родилась 1 сентября 1967 года в Свердловске. Окончила филологический факультет Уральского государственного университета имени А.М. Горького, по специальности «Русский язык и литература». С 1989 по 2000 год работала педагогом в Свердловске и Краснодаре.

В 1997 году стала победителем профессионального конкурса «Учитель года Кубани», награждена нагрудным знаком «Учитель года». В 2002 году присвоено почетное звание «Заслуженный учитель Кубани».

С 2003 по 2009 год была проректором по организационно-методической и научной работе Краснодарского краевого института дополнительного профессионального педагогического образования. С 2009 года по 2015 год руководила управлением общего и дошкольного образования министерства образования и науки Краснодарского края.

В декабре 2015 года была назначена заместителем министра образования, науки и молодежной политики региона. С мая 2018 года исполняла обязанности главы ведомства.